Война Стороны Земли и Принципата Зеона переходит в новую, еще более жестокую фазу. После разрушительной битвы за Торговую станцию «Тыква», выжившие пилоты элитного отряда «Удар молнии» оказываются разбросаны по разным уголкам космоса. Ио Флеминг, чей психика и тело подверглись колоссальной нагрузке от синхронизации с прототипом психо-гандама «Атлас», пытается найти свое место в мире, где грань между человеком и машиной становится все более призрачной. Его преследуют видения и голоса погибших врагов, а жажда мести за уничтоженную колонию превращается в навязчивую идею. Тем временем, его заклятый друг и соперник, пилот Зеона Дарил Лоренц, получает новое задание — испытать на поле боя усовершенствованный мобильный доспех «Психо-Заку», созданный для того, чтобы превзойти возможности «Атласа». Дарил, потерявший конечности и часть души в предыдущих сражениях, все глубже погружается в пучину кибернетизации, превращаясь в идеальное оружие, лишенное человеческих слабостей.
Судьба вновь сталкивает Ио и Дарила в эпицентре тайной операции, разворачивающейся вокруг нейтральной колонии «Ла-Тур». Обе стороны конфликта стремятся заполучить секретные данные о новой технологии «Луны», способной переломить ход войны. В ход идут не только мобильные доспехи, но и грязные политические интриги, шпионаж и предательство. Ио, разрываясь между приказами командования и собственной совестью, вынужден вступить в бой, чтобы защитить мирных жителей, оказавшихся меж двух огней. Дарил же, следуя логике войны, видит в уничтожении колонии единственный способ выполнить миссию. Их финальная дуэль на фоне рушащихся конструкций «Ла-Тур» становится не просто столкновением двух гандамов, а битвой мировоззрений, где каждый делает свой последний выбор. В этом аду из стали и пламени, где технологии вознесли человека до уровня бога войны, только один сможет выжить, чтобы задать себе вопрос: была ли эта победа на самом деле поражением.
