Третий сезон «Музыкальной школы звёзд» начинается с того, что Академия Кагураока получает приглашение на престижный международный фестиваль «Золотая партитура». Однако радость омрачается условием: каждая школа может выставить только одного сольного исполнителя. Это ставит под удар дружбу главных героев — Каната, Рин и Сосукэ, которые привыкли выступать вместе. Каждый из них по-своему талантлив, но директор объявляет, что место достанется тому, кто лучше всех сыграет новую, незнакомую композицию. Параллельно в школе появляется загадочный новый ученик — Юки, который виртуозно владеет скрипкой, но отказывается участвовать в конкурсах. Выясняется, что он — бывший вундеркинд, бросивший музыку после травмы руки. Каната, пытаясь помочь Юки, случайно узнает, что его собственная техника игры основана на неправильной постановке пальцев, что грозит ему потерей подвижности кисти. Теперь героям предстоит не только бороться за место на фестивале, но и переосмыслить своё отношение к музыке: для них она перестаёт быть соревнованием и превращается в способ исцеления.
Пока Каната скрывает свою травму и пытается освоить новую технику игры, Рин сталкивается с давлением со стороны родителей, которые требуют, чтобы она бросила музыкальную школу ради «серьёзной» карьеры. Сосукэ, всегда бывший опорой группы, впервые чувствует себя лишним, когда его бас-гитара оказывается не нужна для сольного выступления. Конфликт достигает пика на отборочном концерте, где Каната, не выдержав боли, срывает выступление. В этот момент Юки, наблюдавший за ним из зала, неожиданно выходит на сцену и начинает играть дуэтом, импровизируя так, чтобы скрыть ошибки друга. Их совместная музыка оказывается настолько пронзительной, что жюри предлагает отправить на фестиваль не одного солиста, а весь ансамбль. Но директор непреклонен: правила есть правила. В финале сезона герои решают нарушить устав академии и тайно покидают школу, чтобы выступить на фестивале всем составом, рискуя быть исключёнными. Их выступление под открытым небом, где к ним присоединяется даже Юки, становится символом того, что настоящая музыка рождается не из соперничества, а из единства и взаимопомощи. Сезон заканчивается клиффхэнгером: на следующее утро после триумфа директор объявляет, что Академию Кагураока хотят закрыть из-за финансовых проблем, и спасти её может только победа в главном конкурсе года.
