Второй сезон «Музыкальной школы звёзд» начинается с того, что привычный ритм академии нарушен. После триумфа на прошлогоднем фестивале «Золотая нота» ученики старшего отделения готовятся к главному испытанию — гастрольному туру по стране, который может стать билетом в профессиональную индустрию. Но радость омрачена: в школу поступает таинственная переводная ученица Мияко, которая демонстрирует феноменальный слух и технику, но отказывается выступать в ансамбле. Её появление раскалывает дружный коллектив — кто-то видит в ней угрозу, а кто-то, как главный герой Кэнта, пытается понять причины её замкнутости. Параллельно выясняется, что директор школы скрывает финансовые проблемы, и если тур провалится, академию могут закрыть. Давление нарастает: старые друзья ссорятся из-за сольных партий, а новички из младших классов пытаются доказать, что достойны места в основном составе.
Во втором акте сезона напряжение достигает пика. Во время репетиций Мияко случайно срывает выступление, и группа распадается на два лагеря. Кэнта, пытаясь спасти ситуацию, узнаёт, что Мияко когда-то была вокалисткой популярной группы, но пережила травму из-за предательства продюсера. Он предлагает ей не сольный номер, а дуэт, который должен объединить их стили — его эмоциональный рок и её безупречный джаз. Однако накануне первого концерта тура у одного из ключевых участников пропадает голос из-за стресса. Команде приходится за ночь переписать аранжировки, а Мияко впервые берёт на себя роль лидера. Финальный концерт проходит на грани срыва: техника даёт сбой, но герои импровизируют, превращая ошибки в часть шоу. Зал взрывается овациями, а Мияко наконец признаётся, что её страх был не перед сценой, а перед доверием. Школу удаётся спасти, но в финальной сцене директор получает письмо от таинственного спонсора, который ставит условие: следующий сезон должен стать полностью экспериментальным, иначе контракт расторгнут. Герои понимают, что их ждёт ещё более жёсткая борьба за право оставаться собой.