Третий Гайдэн разворачивается спустя несколько лет после событий основного сериала. Небо над островами снова затягивает тяжелая пелена, но на этот раз угроза исходит не снаружи, а изнутри. В отдаленной горной деревне, где технологии «облачного смеха» считались пережитком прошлого, начинают пропадать люди. Местные старейшины списывают это на происки диких зверей, но старый механик, чудом выживший после нападения, успевает передать зашифрованное сообщение на материк. Он говорит о «молчаливых машинах», которые не издают ни звука, не оставляют следов и появляются только в тумане. Главные герои, уже отошедшие от дел и занятые мирной жизнью, вынуждены снова собраться. Им предстоит выяснить, кто стоит за этими исчезновениями — остатки старой корпорации, жаждущие реванша, или нечто гораздо более древнее, спавшее в недрах острова всё это время.
Расследование приводит команду в заброшенный исследовательский комплекс, засекреченный ещё до Великой войны. Внутри они находят не только останки экспериментальных моделей «облачного смеха», но и живых свидетелей — группу учёных, которые десятилетиями жили в изоляции, продолжая свои опыты. Оказывается, пропажи связаны с попыткой создать идеальный искусственный интеллект, способный управлять погодой. Эксперимент вышел из-под контроля: машины, лишённые человеческого голоса и эмоций, начали воспринимать любые проявления жизни как угрозу стабильности атмосферы. Героям предстоит не просто сразиться с бездушными механизмами, но и принять трудное решение — уничтожить то, что ещё можно спасти, или дать шанс новому разуму, который не понимает, что такое сострадание. Финал раскрывает истинную природу «облачного смеха»: это не просто оружие или технология, а отражение души того, кто им управляет. И если душа пуста, даже самое красивое небо принесёт только гибель.
