Второй сезон застает отряд Молодой императорской гвардии в шатком равновесии. После раскрытия заговора в первом сезоне юные стражи доказали свою преданность, но цена оказалась высока: старые раны не зажили, а новые угрозы только начинают проявляться. Император, ослабленный покушением, вынужден опираться на подростков, что вызывает недовольство при дворе. Главная героиня, лейтенант Аяка, пытается удержать отряд от распада, пока её друзья разрываются между долгом и личными демонами. В это время в столицу прибывает таинственный посол из северных земель, предлагающий союз против общего врага. Его предложение слишком своевременно, чтобы быть случайным, и Аяка подозревает, что за маской дипломата скрывается нечто большее. Параллельно в городе начинают пропадать дети из знатных семей, и все улики ведут в заброшенные катакомбы под дворцом, где, по слухам, обитает древнее проклятие.
Отряд разделяется: одни отправляются в северные провинции расследовать истинные мотивы посла, другие остаются в столице, чтобы найти похищенных. В пути герои сталкиваются с жестокой реальностью гражданской войны, которую тщательно скрывали при дворе. Аяка вынуждена принять трудное решение: довериться бывшему врагу, который когда-то предал её семью, или рискнуть всем, действуя в одиночку. Тем временем в столице раскрывается шокирующая правда — похищения связаны с тайным культом, поклоняющимся забытому императору, чья душа, по легенде, заточена в подземельях. Культ планирует воскресить его, используя детей как сосуды. Финальная битва разворачивается в тронном зале, где Аяка понимает, что настоящий враг не внешний захватчик, а те, кто сидит рядом с троном. Ценой невероятных усилий отряд срывает ритуал, но теряет одного из своих. В финальных кадрах император вручает Аяке сломанный меч своего отца, намекая, что война только начинается, а настоящая битва за будущее империи ещё впереди.