Юки — обычный старшеклассник, который больше всего на свете ценит покой и предсказуемость. Его жизнь переворачивается вверх дном, когда он находит в школьной библиотеке старую, пыльную тетрадь с надписью «Дневник мистических существ». Стоит ему открыть её, как из страниц вылетает крошечное, ворчливое существо, похожее на помесь белки и дракона. Оно представляется хранителем дневника и заявляет, что отныне Юки — новый «регистратор». Теперь его обязанность — находить, описывать и зарисовывать всех необычных созданий, которые тайно живут среди людей: от застенчивых кицунэ, прячущихся в городских парках, до капризных водяных, поселившихся в школьном бассейне. Поначалу Юки пытается игнорировать свою ношу, но существа начинают сами являться к нему, ломая быт и втягивая в абсурдные ситуации. Каждая новая запись в дневнике — это не просто наблюдение, а ключ к пониманию скрытого мира, где магия переплетается с повседневностью.
Постепенно Юки замечает, что его записи обладают странной силой: описанное в дневнике существо начинает вести себя в соответствии с его заметками. Если он назвал водяного ленивым, тот действительно перестаёт следить за чистотой пруда. Это открытие становится опасным, когда в городе начинают происходить аномалии — то исчезают тени, то время в одном из кварталов зацикливается. Юки понимает, что кто-то намеренно искажает его дневник, вписывая ложные сведения, чтобы посеять хаос среди мистических существ и людей. Вместе с хранителем и несколькими подозрительно осведомлёнными одноклассниками он вынужден расследовать, кто стоит за диверсией. Подозрения падают на загадочную организацию «Корректоры», которая веками стирает любые упоминания о магии из человеческой памяти. Теперь Юки предстоит не только защитить свой дневник от кражи, но и решить, стоит ли сохранять хрупкое равновесие между двумя мирами или позволить людям наконец узнать правду о соседях по планете.
