Второй сезон «Клинков Хранителей» начинается с того, что мир, едва оправившийся от потрясений, снова оказывается на грани катастрофы. После событий первого сезона главный герой, наконец, овладевший силой легендарного клинка, сталкивается с новой угрозой — пробуждением древнего зла, которое было запечатано тысячи лет назад. Враги становятся не просто сильнее, они начинают охотиться за теми, кто связан с хранителями, уничтожая целые деревни и города в поисках артефактов. Герой вынужден покинуть привычные земли и отправиться в опасное путешествие на север, где, по слухам, находится последний оплот сопротивления. Там он встречает выживших хранителей из других кланов, которые не доверяют друг другу, но вынуждены объединиться перед лицом общего врага. Вместе они пытаются расшифровать древние пророчества, которые указывают на то, что истинная сила клинка раскроется только после того, как герой пожертвует чем-то самым дорогим. Параллельно раскрывается тайна прошлого главного злодея — оказывается, он был одним из первых хранителей, преданных своими же соратниками, и теперь его жажда мести грозит уничтожить весь мир.
Во втором сезоне акцент смещается с простых сражений на внутреннюю борьбу персонажей. Герой сталкивается с предательством в своих рядах: один из новых союзников оказывается шпионом, а другой — потомком тех, кто когда-то запечатал зло, но теперь хочет использовать его силу в своих целях. Отношения между персонажами накаляются до предела, особенно когда выясняется, что для активации полной мощи клинка нужно убить невинного человека, и этот выбор ложится на плечи главного героя. В финальных эпизодах происходит масштабная битва в руинах древнего храма, где каждый из хранителей демонстрирует свои уникальные способности, но цена победы оказывается чудовищной. Один из ключевых персонажей погибает, спасая остальных, а главный герой теряет руку, но обретает истинное понимание своего долга. Сезон заканчивается клиффхэнгером: злодей не уничтожен, а лишь временно запечатан, и в последней сцене показано, как из тени выходит еще более могущественная фигура, которая наблюдала за всеми событиями с самого начала, намекая на то, что настоящая война только начинается.